«آیت الله سید محمود هاشمی شاهرودی» نایب رئیس مجلس خبرگان رهبری شامگاه پنج شنبه سوم تیر 1395 با «آیت الله عیسی قاسم» به صورت تلفنی گفت و گو کرد.
آیت الله شاهرودی در این گفت و گو با اشاره به اینکه به جایگاه بزرگ اسلامی و ملی آیت الله عیسی قاسم افتخار می کند، اظهار داشت: آیت الله قاسم نمادی برای مذهب تشیع، اسلام و امت اسلامی است و این مرد برجسته، نقش بزرگی را ایفا می کند.
در ادامه این گفت و گو، آیت الله شاهرودی با محکومیت تعدی به آیت الله عیسی قاسم، اعلام آمادگی کرد که هر کاری را که برای دفاع از آیت الله عیسی قاسم و رفع مظلومیت از وی لازم است، انجام دهد.
آیت الله عیسی قاسم، این توجه کریمانه از استادش آیت الله شاهرودی را گرامی داشت و از او درخواست کرد که دعا کند که خداوند بین او و طاعتش، جدایی نیندازد و هر رنجی را که می برد، خداوند در راه خودش قرار بدهد.
همچنین آیت الله عیسی قاسم تاکید کرد که برای مسلمانان چیزی جز خیر نمی خواهد و در خصوص حفظ امنیت بحرین و جهان اسلام و وحدت مسلمین حساس است.
آیت الله شاهرودی در بخش پایانی این گفت و گو گفت که من به رهبری حکیمانه آیت الله عیسی قاسم بر ملت مومن بحرین افتخار می کنم و عقلانیت شیوه ای مناسب برای تدبیر امور در راستای مصلحت کشور و ملت است.
رژیم بحرین چند روز پیش در ادامه رفتارهای عجیب و غیر انسانی خود، تابعیت آیت الله شیخ عیسی قاسم را لغو کرد. اقدامی که اعتراض قشرهای مختلف مردم بحرین، مراجع عظام تقلید و مقامات کشورهای مختلف را به دنبال داشت.
این اقدام خصمانه رژیم بحرین علیه شهروند دانشمند این کشور، چند روز پس از توقیف "جمعیت اسلامی الوفاق" و بستن دفاتر آن صورت می گیرد. آل خلیفه احزاب "التوعیة" و "الرسالة" را هم منحل اعلام کرده است.